Протоиерей Феодор Бородин родился 8 апреля 1968 года в Москве вторым ребёнком в семье (есть старшая сестра и младший брат). В 1985 году закончил 31 специальную английскую школу. Учился в художественной школе. Работал художником в метродепо "Сокол".
С 1986 по 1988 г. служил в армии – десантные войска, сержант ВДВ. После демобилизации поступил в Московскую духовную семинарию на очное отделение и окончил в 1992 году. 26 января 1992 года венчался с р. Б. Людмилой, ставшей матушкой, а впоследствии – и замечательной мамой. В семье Бородиных восемь детей.
29 марта 1992 года в Елоховском соборе в неделю крестопоклонную Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II рукоположил Федора Бородина в сан диакона.
Отец Федор был направлен вначале в храм святителя Николая в Кленниках, а затем, летом 1992 года, назначен настоятелем во вновь открывающийся храм свв. бессребреников Космы и Дамиана на Маросейке с «последующим рукоположением в священный сан». Рукоположение состоялось 14 октября 1992 г., а через месяц – 14 ноября – новый настоятель отслужил в храме на Маросейке первую литургию.
В 2002 году возведен в сан протоиерея. В 2012 году награжден Крестом с украшениями.